DNA甲基化与环境化学污染物的表观遗传效应 基因环境交互作用的理论与实践2025|PDF|Epub|mobi|kindle电子书版本百度云盘下载

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上篇 DNA甲基化与表观遗传3

第一章 DNA甲基化及其意义3

第一节 DNA甲基化与CpG岛3

第二节 DNA甲基化机制5

一、DNA甲基化的模式6

二、DNA甲基转移酶7

三、RNA干扰与DNA甲基化8

第三节 DNA甲基化与基因表达调控8

一、DNA甲基化与X染色体失活9

二、DNA甲基化与遗传印迹9

三、DNA甲基化与染色质结构10

四、DNA甲基化抑制基因表达机制13

五、DNA去甲基化15

第四节 DNA甲基化与肿瘤16

一、DNA甲基化、基因突变与肿瘤17

二、DNA损伤修复基因过甲基化与肿瘤19

三、抑癌基因的过甲基化与肿瘤20

四、低甲基化与肿瘤20

五、去甲基化药物作用机制及其在肿瘤治疗中的应用21

六、DNA甲基化与肿瘤发生机制新观念22

第五节 DNA甲基化与组蛋白甲基化23

第二章 DNA甲基化检测技术27

第一节 定性甲基化检测方法27

一、甲基化敏感的限制性内切酶法／核酸杂交法27

二、限制性内切酶-PCR法28

三、HSO3-PCR-RFLP法以及HSO3-PCR-SSCP法29

四、基因组直接测序法30

五、甲基化特异性PCR法32

第二节 早期定量甲基化检测方法32

一、亚硫酸氢钠基因组测序法32

二、结合亚硫酸氢钠和限制性内切酶分析法34

三、甲基化敏感的单核苷酸引物延伸法35

四、MethyLight甲基化分析方法36

第三节 全基因组总体甲基化检测方法38

一、变性高效液相色谱法38

二、酶区域性甲基化检测38

三、基因组DNA甲基化毛细管电泳分析方法38

第四节 基因组DNA甲基化高通量检测技术39

一、DNA甲基化MALDI质谱检测技术39

二、基于寡核苷酸微阵列技术40

三、焦磷酸测序甲基化分析技术40

四、基于MSP的DNA甲基化高通量检测方法43

五、甲基化CpG岛回收DNA甲基化谱分析方法45

第三章 环境应激与表观遗传学改变47

第一节 环境重金属暴露与表观遗传学改变47

一、镍47

二、镉48

三、砷48

四、铅48

五、铬49

六、甲基汞49

第二节 环境有机物暴露与表观遗传学改变49

一、多环芳烃49

二、苯50

第三节 其他环境暴露与表观遗传学改变50

一、空气颗粒物50

二、石棉51

第四章 DNA甲基化的研究进展52

第一节 人类表观遗传计划52

第二节 DNA甲基化研究的发展方向54

参考文献58

下篇 化学污染物去甲基化表观遗传毒性QDMP定量方法研究75

第五章 概述75

第一节 研究背景75

一、表观遗传毒性是化学品安全性评价的新问题75

二、DNA去甲基化相关实用评估方法有待创立76

三、甲基化EGFP细胞重组为评价污染物表观遗传毒性开拓新途径78

第二节 研究内容与技术路线80

一、研究内容80

二、技术路线81

第六章 高甲基化C3质粒制备和人工重组HepG2细胞株构建82

第一节 材料与方法82

一、实验材料82

二、实验方法83

第二节 结果90

一、C3质粒被ApaLI和EcoRI双酶切效果90

二、C3质粒长片段与短片段的回收90

三、C3质粒甲基化效果双酶切验证91

四、C3质粒转染HepG2细胞株92

第三节 讨论92

第七章 QDMP方法基本原理验证和性能测试94

第一节 材料与方法94

一、实验材料94

二、实验方法96

第二节 结果102

一、QDMP检测方法的基本原理可行性102

二、5-AZA-CdR染毒与HepG2细胞EGFP表达的响应关系109

三、QDMP检测方法的灵敏性和稳定性112

第三节 讨论113

第八章 污染物去甲基化表观遗传毒性测试案例115

第一节 QDMP检测方法在环境安全领域的初步应用115

一、材料与方法115

二、结果评价120

第二节 QDMP检测方法在化学品安全领域的初步应用123

一、材料与方法123

二、结果评价124

第三节 QDMP检测方法在食品安全领域的初步应用124

一、材料与方法124

二、结果评价126

第四节 讨论127

第九章 小结及展望128

参考文献131

附录137

附录1 HepG2细胞介绍137

附录2 EGFP-C3质粒介绍138

附录3 实验中使用的EGFP-C3质粒全序列及关键酶切位点139

附录4 实验中使用的C3质粒全序列与甲基化定量检测片段143

附录5 BSP测序涉及的C3质粒原始序列和亚硫酸氢钠处理后的序列147

附录6 实验中使用的主要工具酶149

附录7 实验中使用的主要引物信息150

附录8 甲基化测序结果比对方法（N-BLAST）151

附录9 名词缩略语表154