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数学与21世纪生物学
  • 美国能源部计算生物学项目数学科学研究委员会,美国国家学术院国家研究委员会著 著
  • 出版社: 北京:清华大学出版社
  • ISBN:9787302395485
  • 出版时间:2015
  • 标注页数:232页
  • 文件大小:29MB
  • 文件页数:248页
  • 主题词:数学-应用-生物学-研究

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图书目录

执行摘要1

建议2

建议的理由5

生物学的首要地位10

不可预测性12

未来前景13

1 领域的性质15

引言15

数学与生物学的交叉16

近年来有什么变化?19

计算生物学问题困难的原因是什么?25

数学与生物科学成功互动的常见因素27

为改善两个领域的利益协作打好基础31

本报告的结构37

参考文献38

2 历史上的成功40

种群生物学的开端40

通过同源性推断基因功能42

种群进化过程45

建模47

医学和生物学成像48

总结50

参考文献50

3 了解分子53

引言53

数学-生物学关系54

分子的数学应用领域57

序列分析57

结构分析60

动力学64

相互作用65

未来方向67

参考文献69

4 了解细胞71

引言71

这些问题的范例73

细胞结构76

细胞网络及其功能的发现79

从网络到细胞功能83

从细胞到组织90

数据整合94

生物学方面的考虑96

未来方向99

参考文献101

5 了解生物体117

心脏生理学119

循环生理学123

呼吸生理学124

信息、处理125

内分泌生理学127

形态发生和模式生成128

运动132

癌症133

针对靶向肿瘤细胞的治疗输送134

药物作用的机制134

细胞群体的生长和分化134

抗性的发展135

HIV-1感染的体内动力学136

未来方向138

参考文献139

6 了解种群148

种群遗传学148

种群的生态方面155

生态学与进化论的综合158

参考文献160

7 了解群落和生态系统165

计算174

未来方向176

参考文献184

8 横切主题195

“小n,大P”问题195

发现基因表达数据中的模式197

有监督学习200

无监督学习203

有序系统的分析205

隐马尔可夫模型在DNA、RNA和蛋白质序列分析中的应用206

序列谱隐马尔可夫模型207

基因发现中的隐马尔可夫模型209

蒙特卡罗方法在计算生物学中的应用211

模体发现中的吉布斯采样212

调控网络的推断213

蛋白质构象采样214

目前引入的数学主题的经验教训215

低级数据的处理216

结束语220

参考文献221

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