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导言1

第1章 进化论公理化的几个方案14

1.1 鲁斯论进化论的结构14

1.1.1 所有的进化研究都预设群体遗传学15

1.1.2 进化论的公理化是可能的吗？18

1.2 玛丽·威廉斯的公理化方案21

1.2.1 公理和定义21

1.2.2 族和亚族24

1.2.3 达尔文毕奥卡26

1.2.4 玛丽公理化方案的恰当性33

1.3 遗传学理论的结构主义重构36

1.3.1 结构主义的理论观概述37

1.3.2 抽象的交配演算39

1.3.3 性状—因子遗传学（经典遗传学）的核心（CFG）41

1.3.4 分子遗传学（MOLGEN）44

1.3.5 从CFG到MOLGEN的还原47

1.4 进化论的语义观重构52

1.4.1 汤普森的方案53

1.4.2 劳埃德的重构方案56

1.5 进化生物学的理论化及其多样性60

1.5.1 学科的定义问题60

1.5.2 语义观的不恰当性64

1.5.3 为什么进化论不是一个统一的理论？67

第2章 达尔文的理论观与论证方法71

2.1 关于《物种起源》论证结构的几种重构方案71

2.1.1 达尔文是否遵循假说—演绎法？71

2.1.2 最佳解释推理77

2.1.3 模型与假设：两种论证途径78

2.1.4 达尔文的总体论证策略81

2.2 一个多元论的分析85

2.2.1 《物种起源》的总体框架85

2.2.2 达尔文是不是归纳主义者？90

2.2.3 达尔文是怎样使用类比方法的？99

2.2.4 最佳解释推理与回应反驳策略103

2.3 达尔文为什么采用多种论证模式107

第3章 进化解释的两种模式110

3.1 进化论的统计特征及其意义110

3.1.1 工具主义命题及其论证111

3.1.2 对工具主义命题的反驳115

3.1.3 进化论的统计特征有不同的来源121

3.2 动力学的解释模式125

3.2.1 索伯尔的类比125

3.2.2 索伯尔类比的不恰当性126

3.3 统计学的解释模式128

3.3.1 自然选择的多层实现模型129

3.3.2 对自然选择多层实现模型的批评131

3.4 两种解释模式的关系138

3.4.1 群体遗传学的“翻译手册”138

3.4.2 依随关系不能统一两种解释模式141

第4章 进化生物学中的规律问题144

4.1 进化过程的复杂性与严格定律145

4.1.1 什么是自然定律145

4.1.2 关于严格定律147

4.1.3 怎样理解进化现象的复杂性149

4.2 进化的偶然性命题155

4.2.1 进化史事件的唯一性156

4.2.2 进化史事件的偶然性157

4.3 先验定律与局部的经验定律158

4.3.1 模型与先验定律159

4.3.2 从事实概括到规律概括的连续统161

4.4 进化定律的类型163

4.4.1 公认观点的规律标准不是先天合理的163

4.4.2 解释目标决定解释性原理的类型167

第5章 选择与适应172

5.1 自然选择原理的解释和预见功能172

5.1.1 什么是自然选择？172

5.1.2 同义反复问题的几种解决方案181

5.1.3 自然选择原理的误用188

5.2 对适合度的不同解释及其问题194

5.2.1 生态学定义和群体遗传学定义194

5.2.2 适合度的倾向解释200

5.2.3 适合度作为未定义的初始词项207

5.2.4 生物学家怎样使用适合度概念？209

5.3 适应主义的解释纲领213

5.3.1 什么是适应主义？213

5.3.2 适应主义与可检验性问题217

5.3.3 发育约束问题：适应主义与反适应主义的互补关系223

第6章 选择的层次与单位228

6.1 关于选择单位的问题228

6.1.1 问题的起因与演变228

6.1.2 单位与层次233

6.2 利他主义的进化模型238

6.2.1 利他主义进化的群体选择模型238

6.2.2 亲族选择理论242

6.2.3 基因选择理论246

6.3 多层选择论中的争论249

6.3.1 协变与关联249

6.3.2 实在与约定255

6.4 关于物种选择的争论260

6.4.1 大进化与物种选择261

6.4.2 物种的聚合性状与突现性状264

第7章 物种概念及其哲学问题269

7.1 分类学与物种概念269

7.1.1 阶元与单元269

7.1.2 定义物种的方法271

7.2 物种概念的本体论问题274

7.2.1 物种是个体还是集合？275

7.2.2 多元论与实在论282

7.2.3 三维实体与四维实体293

7.3 分类学与科学哲学297

7.3.1 分类学的基础297

7.3.2 谱系的推导及其困难300

第8章 依随、还原与统一308

8.1 个体的生态学性质与群体的遗传学性质308

8.1.1 适合度的物理基础308

8.1.2 对依随关系的分析312

8.1.3 解释性还原与理论还原的条件317

8.2 大进化与小进化326

8.2.1 大进化及其进化速率问题326

8.2.2 大进化向小进化的还原331

主要参考文献335

索引346