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第一篇 概论3

第1章 海洋微型生物生态学导论3

1.1 什么是海洋微型生物3

1.2 为什么要研究海洋微型生物生态学4

参考文献7

第2章 海洋微型生物研究历程9

2.1 海洋微型生物研究三步曲9

2.2 海洋微型生物研究的里程碑14

参考文献26

第3章 我国的海洋微型生物研究32

3.1 我国海洋微型生物生态学研究简要历程32

3.2 我国海洋微型生物生态学研究的重要认识38

参考文献57

第二篇 典型微型生物类群的生态学第4章 原绿球藻（Prochlorococcus）69

4.1 原绿球藻的发现与分离培养69

4.2 原绿球藻的细胞结构与生理特征71

4.3 原绿球藻的自然生态学77

4.4 原绿球藻的分子生态学81

4.5 中国海的原绿球藻生态学88

参考文献95

第5章 聚球藻（Synechococcus）101

5.1 聚球藻的细胞生理学101

5.2 聚球藻的自然生态学105

5.3 聚球藻的分子生态学108

5.4 中国海的聚球藻生态学119

参考文献125

第6章 超微型真核生物（Pico-eukaryotes）129

6.1 概述129

6.2 最小的真核生物（Ostreococcus tauri）131

6.3 球石藻（Coccolithophorid）133

6.4 棕囊藻（Phaeocysits）143

6.5 中国海的超微型真核自养生物生态学148

参考文献156

第7章 海洋异养细菌（Heterotrophic Bacteria）163

7.1 概述163

7.2 海洋异养细菌的主要类群164

7.3 异养细菌在海洋生态系统中的作用与功能168

7.4 中国海的异养细菌生态学176

参考文献190

第8章 海洋古菌（Marine Archaea）194

8.1 概述194

8.2 海洋古菌的生境及主要类群200

8.3 中国海的浮游古菌生态学208

参考文献212

第9章 好氧不产氧光合异养菌（AAPB）217

9.1 概述217

9.2 海洋AAPB的生理特性与分子生物学特征218

9.3 AAPB在海洋生态系统中的作用229

9.4 中国海的AAPB生态学231

参考文献242

第10章 含视紫质浮游细菌249

10.1 变形细菌视紫质的发现和功能特点249

10.2 PR多样性256

10.3 中国海的PR细菌研究263

参考文献269

第11章 浮游病毒（Planktonic Viruses/Phages）272

11.1 概述272

11.2 浮游病毒的基本结构及其主要类群272

11.3 海洋浮游病毒的生态学研究276

11.4 海洋浮游病毒的多样性281

11.5 海洋浮游病毒的生态功能286

11.6 中国海的浮游病毒生态学291

参考文献299

第12章 中国海微型生物的动态变化及其调控机制304

12.1 边缘海的生态环境特征305

12.2 微型生物的季节变动规律与影响因素307

12.3 超微型生物的空间变动规律与环境调控机制316

12.4 边缘海超微型生物类群间的关系与相互作用326

12.5 边缘海超微型生物类群对人为活动的响应330

参考文献335

第三篇 微型生物的研究方法与技术第13章 海洋微型生物分离培养技术341

13.1 海洋细菌的分离培养341

13.2 超微型藻类的分离培养345

13.3 微型生物种群生长与连续培养349

13.4 海洋细菌的极限稀释培养及高通量筛选353

参考文献358

第14章 微型生物的生理生态学新技术360

14.1 微型生物的流式细胞检测、分析、分选技术360

14.2 微型生物粒径谱与流式细胞检测370

14.3 海洋微型生物流式图像技术371

14.4 海洋浮游细菌生物量的流式细胞测定技术378

14.5 海洋浮游细菌细胞膜电位测定技术386

14.6 时序红外显微数字化（TIREM）技术397

14.7 微型生物的细胞活性测定技术409

14.8 原子力显微镜技术在海洋微型生物研究中的应用417

14.9 酶联放大-荧光原位杂交技术（CARD-FISH）425

14.10 荧光原位杂交-微放射自显影技术（Micro-FISH）430

14.11 海洋微型生物碳源利用分析技术434

参考文献439

第15章 海洋微型生物生态研究主要分子生物学技术449

15.1 核糖体16S rRNA基因序列的扩增分析449

15.2 变性梯度凝胶电泳（DGGE）和温度梯度凝胶电泳（TGGE）454

15.3 末端限制性片段长度多态性分析（T-RFLP）458

15.4 实时定量PCR技术462

15.5 环境基因组学技术466

15.6 原位PCR技术470

15.7 分子系统发育分析474

15.8 海洋微型生物群落蛋白质组学478

参考文献485

附录489

第一部分 微型生物海上采样常规操作规程489

第二部分 分子生态学操作规程492

第三部分 海洋细菌常用的培养基配方511

缩略语519