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第1章 绪论1

1.1 安装ChemDraw1

1.1.1 安装ChemDraw对操作系统的要求1

1.1.2 安装ChemDraw1

1.1.3 启动程序1

1.2 ChemDraw界面结构1

1.2.1 文件窗口2

1.2.2 图形工具图标板2

1.3 菜单和操作命令5

1.3.1 菜单中命令的选择5

1.3.2 命令不同显示的意义5

1.3.3 Undo和Redo命令5

1.4 对话框7

1.4.1 对话框中命令的操作7

1.4.2 对话框的组成7

1.5 默认设置的变化8

1.5.1 Preferences命令8

1.5.2 Document settings命令9

1.5.3 存储定型设置11

1.5.4 其他文件的应用设置11

1.6 ChemDraw文件操作11

1.6.1 ChemDraw文件的建立11

1.6.2 打开ChemDraw文件11

1.6.3 存储ChemDraw文件13

1.6.4 关闭文件14

1.6.5 快速访问文件14

1.6.6 打印文件15

1.6.7 退出文件15

第2章 实例指导16

2.1 实例指导l 反应方程式16

2.1.1 绘制前的操作准备16

2.1.2 绘制实例17

2.2 实例指导2 绘制中间体结构22

2.3 实例指导3 复杂环结构25

2.4 实例指导4 Fischer葡萄糖结构图27

2.5 实例指导5 绘制透视图形30

2.6 实例指导6 Newman结构32

第3章 化学结构的绘制36

3.1 单键工具36

3.1.1 实键工具36

3.1.2 楔键和配键工具38

3.1.3 信息区域39

3.1.4 单击加键和拖曳加键39

3.2 多重键的绘制40

3.2.1 绘制双键40

3.2.2 绘制双抉择键40

3.2.3 绘制叁键40

3.2.4 单键和双键实例41

3.3 环工具42

3.3.1 环己烷环工具的选择42

3.3.2 绘制环己烷42

3.3.3 环己烷凳环工具43

3.3.4 绘制不定域共扼环43

3.3.5 环戊二烯环和苯环工具44

3.4 无环链44

3.4.1 无环链工具44

3.4.2 加链44

3.5 绘制设置46

3.5.1 线的宽度46

3.5.2 黑体的宽度46

3.5. 3 切割线间的距离46

3.5.4 多重键的键间距离46

3.6 编辑键47

3.6.1 变化键的类型47

3.6.2 楔键和配键的定位48

3.6.3 双键线的定位48

3.6.4 移动原子48

3.6.5 键的前后交叉49

第4章 文本说明和原子标记50

4.1 文本50

4.1.1 说明文本50

4.1.2 说明文本的宽度51

4.1.3 编辑说明的内容51

4.1.4 说明文本的字体、字号和字形52

4.1.5 格式对话框54

4.1.6 变化默认设置54

4.1.7 说明文本的调整和行间距55

4.1.8 输入非罗马字体55

4.2 原子符号的标记56

4.2.1 原子符号的标记56

4.2.2 原子标记的调整59

4.2.3 原子标记行间距62

第5章 绘制轨道和化学符号63

5.1 轨道63

5.1.1 轨道工具63

5.1.2 s-轨道63

5.1.3 o-轨道64

5.1.4 单瓣型轨道64

5.1.5 P-轨道64

5.1.6 杂化轨道65

5.1.7 d-轨道65

5.1.8 dz-轨道65

5.2 化学符号65

5.2.1 化学符号工具65

5.2.2 H-点和H-划66

5.2.3 孤对电子66

5.2.4 自由基66

5.2.5 阳离子和阴离子67

5.2.6 电荷67

5.2.7 立体化学标旗67

5.2.8 旋转化学符号68

第6章 绘制箭头、弧及其他图形69

6.1 箭头69

6.1.1 箭头工具69

6.1.2 绘制箭头70

6.1.3 编辑箭头70

6.2 基元71

6.2.1 基元工具71

6.2.2 方框72

6.2.3 圆和椭圆72

6.2.4 单括弧73

6.2.5 对括号73

6.2.6 线73

6.2.7 短键74

6.2.8 编辑结构基元74

6.3 弧形工具76

6.3.1 绘制弧76

6.3.2 编辑弧76

6.4 笔77

6.4. 1 笔工具77

6.4.2 单击绘制77

6.4.3 按动绘制曲线78

6.4.4 编辑曲线78

6.4.5 改变图形79

6.4.6 添加一条线段79

6.4.7 删除一条线段80

6.4.8 曲线不同的应用类型80

第7章 选择应用82

7.1 使用选择工具82

7.1.1 选择工具82

7.1.2 选择局部结构83

7.1.3 选择整体结构84

7.1.4 选择所有的结构84

7.1.5 添加选择84

7.1.6 取消选择85

7.1.7 删除被选择的结构86

7.2 移动结构87

7.2.1 一般移动操作87

7.2.2 利用剪贴板移动88

7.2.3 移动原子89

7.3 复制结构89

7.3.1 用选择工具复制结构89

7.3.2 复制限制在水平或竖直方向89

7.3.3 利用剪贴板进行复制90

7.4 旋转结构90

7.5 调整结构尺寸91

7.5.1 调整结构尺寸91

7.5.2 度量对话框92

7.5.3 拉曲被选结构93

7.6 连接结构93

7.6.1 化学结构以键连接93

7.6.2 化学结构以原子连接93

第8章 高级绘制技巧95

8.1 用快捷键标记原子95

8.1.1 标记最后被绘制的原子(方法1)95

8.1.2 定位快捷标记原子(方法2)95

8.1.3 选择工具快捷变换原子(方法3)96

8.1.4 标记被选结构中的原子(方法4)96

8.1.5 运用默认的快捷键(方法5)97

8.1.6 快捷键效果(方法6)97

8.1.7 建立快捷键97

8.2 俗名的使用98

8.2.1 俗名98

8.2.2 使用俗名98

8.2.3 定义俗名99

8.2.4 查看俗名100

8.2.5 删除俗名101

8.3 多中心结构与多连接标记101

8.3.1 多中心结构101

8.3.2 多连接标记102

8.3.3 给原子符号加键103

8.3.4 展开标记103

8.3.5 结构整理104

8.4 检查化学结构信息104

8.4.1 检查结构105

8.4.2 分析信息105

8.5 不定连接结构107

8.6 颜色108

8.6.1 Color菜单108

8.6.2 给图形结构着色108

8.6.3 给文本着色109

8.6.4 改变调色板109

8.6.5 给Color菜单增加颜色111

8.6.6 删除颜色111

第9章 绘制查询结构113

9.1 查询结构113

9.2 原子属性的操作113

9.2.1 原子属性113

9.2.2 取代基115

9.2.3 隐含氢116

9.2.4 环键数116

9.2.5 不饱和度117

9.2.6 反应变化117

9.2.7 立体反应118

9.2.8 特殊价态118

9.3 键119

9.3.1 键属性119

9.3.2 键类型120

9.3.3 拓扑121

9.3.4 反应中心121

9.4 通用俗名122

9.5 元素列标记123

9.6 元素非列标记123

9.7 取代基和连接点124

9.7.1 取代基124

9.7.2 连接点工具125

9.8 多连接点126

9.9 匿名取代基127

9.10 导出兼容性127

第10章 模板图形128

10.1 模板工具128

10.2 用模板作图130

10.3 建立模板和模板文档131

10.3.1 建立模板窗口131

10.3.2 建立模板图形132

10.3.3 模板的方向132

10.3.4 调整模板格的大小132

10.3.5 模板面板133

10.3.6 保存模板文档133

第11章 反应标记134

11.1 反应标记图134

11.2 自动标记反应134

11.3 手动标记135

11.4 反应标记图的输出136

11.5 反应标记图的清除136

第12章 页面布局的处理137

12.1 控制绘制区域137

12.1.1 控制绘制区137

12.1.2 在文档窗口内滚动137

12.1.3 页面设置138

12.1.4 变化透视效果140

12.2 安排结构141

12.2.1 使用标尺141

12.2.2 使用交叉准线142

12.2.3 结构图形居中页面144

12.2.4 对齐物体144

12.2.5 分布物体145

12.2.6 层次排序145

第13章 信息共享148

13.1 ChemDraw文档之间的信息传输148

13.1.1 拷贝传输148

13.1.2 剪切传输148

13.1.3 粘贴传输148

13.1.4 按动传输149

13.1.5 自动调节设置150

13.2 嵌入结构图形151

13.3 导人和导出152

13.3.1 用剪贴板导入和导出152

13.3.2 建立SMILES字符串153

13.3.3 剪贴板粘贴SMILES154

13.3.4 建立SLN字符串154

13.4 用文件格式导入和导出155

附录A ChemDraw的化学意义159

A.1 必备工具概述159

A.1.1 必备工具159

A.1.2 惯例限制159

A.1.3 灵活利用工具160

A，2 ChemDraw中的化学分类161

A.2.1 键161

A.2.2 原子符号161

A.2.3 化学-意义文本162

A.2.4 电荷163

A.2.5 同位素和元素163

A.2.6 自由基164

A.2.7 H-点／H-划164

A.2.8 配合物164

A.2.9 多中心连接165

A.2.10 立体化学的标志165

A.2.11 查询属性166

A.2.12 分析信息166

附录B 指定路径168

B.1 Windows系统168

B.2 Macintosh系统169

附录C 技术支持170

C.1 序列号170

C.2 故障检查171

C.2.1 启动171

C.2.2 执行171

C.2，3 系统崩溃172

附录D 文件设置173

D.1 ACS-1996173

D.2 Can.J.Chem173

D.3 J.Mol.Mod174

D.4 RSC-1995174

D.5 Svnthesis／SYNLETT175

D.6 New Document176

D.7 New Slide176

附录E Apple Events(Macintosh)177

附录F 化学文件格式178

F.1 Connection Table格式文件178

F.1.1 对Cyclohexanol结构文件的解释178

F.1.2 Connection Table格式的键类型179

F.2 Standard Molecular Data File格式文件180

附录G Chem3D实例指导183

G.1 利用键工具建立模型183

G.1.1 乙烷模型184

G.1.1.1 建立模型184

G.1.1.2 旋转模型184

G.1.1.3 模型结构信息185

G.1.2 乙烯模型186

G，1.3 环已烷模型186

G.1.3.1 氢原子的隐含186

G.1.3.2 添加原子186

G.1.3.3 添加序列编号和原子符号187

G.2 利用ReplacementText建立模型188

G.2.1 替换元素188

G.2.1.1 单元素变换188

G.2.1.2 多元素变换189

G.2.1.3 利用不同的名存储模型拷贝190

G.2.2 利用符号建立模型190

G.2.2.1 4-甲基-2-戊醇模型190

G.2.2.2 1，2-双甲基环戊烷模型191

G.2.3 利用子结构建立模型191

G.2.3.1 硝基苯分子模型191

G.2.3.2 Ibuprofen分子模型192

G.2.3.3 十肽菌素分子模型192

G.2.3，4 十二丙氨酸醇分子模型193

G.3 检查结构能量194

G.4 检索结构信息198

G.5 ChemDraw与Chem3D信息转换200

G.6 分子轨道201

G.7 绘制表面特性202

附录H ChemFinder实例指导204

H.1 数据库检索204

H.1.1 子结构检索204

H.1.1.1 子结构检索204

H.1.1.2 检索结果验证206

H.1.2 文本检索207

H.1.3 数字检索207

H.1.4 混合检索208

H.2 反应查询208

H.2.1 反应物查询209

H.2.2 产物查询210

H.2.3 产物转变查询210

H.3 表单的制作211

H.3.1 绘制空白表框212

H.3.2 建立表框标签213

H.3.3 制作图片214

H.3.4 用选择工具编辑数据框214

H.3.5 删除框215

H.3.6 储存和关闭215

H.4 打开数据库215

H.4.1 打开BoxProperties对话框215

H.4.2 打开BoxProperties：Database对话框216

H.4. 3 添加内容217

H.5 建立自己的数据库219

H.5.1 建立数据库表单219

H.5.2 字段的建立220

H.5.3 字段的分配222

H.5. 4 数据记录223

H.6 制作子表单224

H.6.1 子表单数据框224

H.6.2 分别打开主表单和子表单数据224

H.6.3 建立主表单和子表单的数据联系225

H.6.4 数据浏览227