图书介绍

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（英）D.R.韦斯特海德（D.R. Westhead）等著；王明怡等译著
出版社：北京：科学出版社
ISBN：703012894X
出版时间：2004
标注页数：274页
文件大小：16MB
文件页数：289页
主题词：生物信息论

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图书目录

A 生物信息学概述1

A1 生物信息学的范围1

A2 生物信息学与互联网4

A3 有用的生物信息学WWW网站8

B 数据采集10

B1 DNA、RNA和蛋白质测序10

B2 蛋白质结构的确定17

B3 基因和蛋白质表达数据19

B4 蛋白质互作数据24

C 数据库——内容、结构和注释30

C1 文件格式30

C2 已注释的序列数据库36

C3 基因组和特定物种的数据库42

C4 其他数据库47

D 生物数据检索52

D1 通过Entrez和DBGET/LINKDB的数据检索52

D2 使用SRS（序列检索系统）的数据检索57

E1 序列相似性搜索61

E 通过序列相似性标准搜索序列数据库61

E2 氨基酸替代矩阵66

E3 数据库搜索：FASTA和BLAST72

E4 序列过滤程序82

E5 数据库的迭代搜索和PSI-BLAST84

F 多序列联配：基因和蛋白质家族88

F1 多序列联配和家族关系88

F2 蛋白质家族和模式数据库92

F3 蛋白质结构域家族97

G 系统发育学102

G1 系统发育学、遗传分类学和存在论102

G2 构建系统发育树108

G3 大分子序列进化114

H 序列注释118

H1 基因组注释原理118

H2 注释工具和资源124

I1 蛋白质结构的概念模型128

I 结构信息学128

I2 蛋白质三维结构与蛋白质功能的关系135

I3 蛋白质结构和功能的进化137

I4 获取、观察和分析结构数据143

I5 结构联配150

I6 已知三维结构的蛋白质分类：CATH与SCOP154

I7 蛋白质结构预测简介158

I8 通过比较建模预测结构161

I9 二级结构预测166

I10 高级蛋白质结构预测与预测策略172

J 微阵列数据分析176

J1 微阵列数据：分析方法176

J2 微阵列数据：工具和资源182

J3 序列采样和SAGE188

K 蛋白质组数据分析192

K1 双向凝胶电泳数据分析192

K2 蛋白质质谱数据分析199

L1 分子途径的建模与重建204

L 高阶模型204

L2 蛋白质互作生物信息学210

L3 高阶模型216

M 生物学中的化学信息学220

M1 分子表示的规范220

M2 化学信息学资源227

N 制药业中的生物信息学233

N1 生物信息学和药物发现233

N2 药物信息学资源238

O 生物信息学计算的基本原理246

O1 运行计算机软件246

O2 计算机操作系统250

O3 软件下载和安装253

O4 数据库管理257

进一步阅读文献260

术语表264