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第一章 绪论1

第一节 生物信息学概述1

第二节 信息学基础10

第二章 医学信息学基础15

第一节 医学信息学概述15

第二节 医学信息学的研究与应用22

第三节 医学信息学发展趋势24

第一节 生物信息学的计算机基础30

第三章 生物信息学的计算机和互联网基础30

第二节 生物信息学的互联网络基础32

第四章 生物信息学中的生物学、分子生物学43

第一节 生物信息学中的生物学、分子生物学基础知识43

第二节 基因工程和核酸研究技术简介52

第五章 生物信息学信息资源检索的常用工具56

第一节 概述56

第二节 通用型检索工具59

第三节 医学专业搜索引擎66

第四节 生物医学信息检索工具的综合利用71

第一节 浏览器及其应用技巧73

第六章 生物信息学网上浏览及网络文件传输73

第二节 文件压缩与解压77

第三节 文件传输与FTP78

第四节 网络蚂蚁80

第五节 离线浏览工具WebZIP82

第六节 文档阅读工具Acrobat Reader84

第七节 图像浏览软件ACDSee85

第一节 重要生物信息中心简介88

第七章 生物医学信息学的重要信息中心和主要数据库88

第二节 生物大分子序列核心数据库92

第三节 生物信息学中常用的三大数据库95

第四节 其他重要的生物医学网站介绍104

第八章 生物医学网络资源及获取107

第一节 网络生物医学资源107

第二节 网络文献数据库检索113

第三节 特殊网络医学资源118

第一节 核酸序列的检索131

第九章 核酸序列分析131

第二节 核酸序列的基本分析132

第三节 核酸序列比对分析135

第十章 基因组信息分析142

第一节 基因组生物信息概述142

第二节 基因组信息分析146

第三节 DNA中的功能性位点搜索150

第十一章 蛋白质序列分析和蛋白质功能预测153

第一节 蛋白质和蛋白质组研究的意义153

第二节 蛋白质序列检索156

第三节 蛋白质序列基本性质分析158

第四节 蛋白质功能预测160

第五节 蛋白质结构预测与结构生物信息学163

第六节 后基因组学、信息学和分子相互作用简介169

第十二章 生物信息学与基因芯片176

第一节 基因芯片概述176

第二节 生物信息学和基因芯片的相互关系182

第三节 生物信息学在基因芯片技术应用中的举例185

第四节 基因芯片制备和应用中的原则及注意事项191

第十三章 生物信息学与生物制药195

第一节 概述195

第二节 生物信息学在新药研发中的作用196

第三节 生物信息学推动了药物基因组学的发展203

第四节 未来药物研究方法展望210

第十四章 医用生物信息学教学实习216

实习一 生物医学网络原始文献的获取216

实习二 核酸序列的搜索与分析218

实习三 PCR引物设计的原理和方法221

实习四 基因组分析225

实习五 蛋白质序列分析227

附录230

附录一常用缩略语及词汇表230

附录二分子生物学与分子遗传学相关数据库表238

附录三生物医学有关数据库表242

附录四生物医学文献数据库表247

参考文献248