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第一章 糖组学技术应用策略1

第一节 糖组学研究概述1

第二节 糖组学研究技术7

参考文献13

第二章 糖基因芯片技术17

第一节 糖基因芯片的制备18

第二节 应用实例26

实例一 糖基因芯片在肝癌细胞中的应用研究26

实例二 糖基因芯片在肝癌患者外周血中的应用研究28

参考文献30

第三章 凝集素芯片技术31

第一节 凝集素芯片制备技术31

第二节 应用实例36

实例一 凝集素芯片检测TGF-β1诱导肝星状细胞活化前后糖蛋白糖链谱36

实例二 凝集素芯片检测肝癌患者和健康志愿者唾液糖蛋白糖链谱39

参考文献41

第四章 凝集素组织化学技术与应用42

第一节 凝集素组化技术42

第二节 应用实例48

实例一 凝集素组化技术用于分析人肝癌组织、肝硬化组织、癌旁组织糖链表达48

实例二凝 集素组化技术用于分析小鼠纤维化肝糖链表达51

实例三凝 集素组化技术用于分析TGF-β1诱导肝星状细胞糖链表达53

参考文献54

第五章 基于凝集素磁性微粒复合物的糖蛋白及其糖链的分离纯化技术56

第一节 凝集素磁性微粒的制备57

第二节 应用实例71

实例一 凝集素Con A磁性微粒复合物应用于血清中糖蛋白的分离纯化及鉴定71

实例二 凝集素磁性微粒复合物应用于细胞中糖蛋白的分离纯化及鉴定80

实例三 凝集素磁性微粒复合物应用于活细胞表面膜糖蛋白的分离纯化及鉴定87

参考文献93

第六章 凝集素-磁性微粒复合物分离及其非标记的蛋白质质谱定量技术94

参考文献108

第七章 滤膜辅助凝集素分离糖肽及其糖基化位点分析技术109

参考文献124

第八章 酰肼化学法分离纯化糖蛋白／糖肽技术125

第一节 酰肼化学法分离纯化糖蛋白／糖肽125

第二节 酰肼功能化磁性微粒分离纯化糖蛋白／糖链131

第三节 应用实例133

实例 酰肼树脂法分离纯化肝癌病人与健康志愿者血清糖蛋白、糖肽、末端唾液酸化糖肽133

参考文献134

第九章 亲水亲和分离纯化糖蛋白技术135

第一节 亲水亲和分离技术135

第二节 应用实例138

实例 亲水亲和技术分离纯化健康志愿者唾液糖蛋白138

参考文献145

第十章 滤膜辅助糖蛋白糖链的分离纯化及其结构质谱解析技术146

第一节 滤膜辅助全糖蛋白N-连接糖链的分离148

第二节 滤膜辅助糖蛋白O-连接糖链的分离152

第三节 滤膜辅助的凝集素分离糖蛋白N-连接糖链155

参考文献159

第十一章 糖芯片制备技术161

第一节 糖芯片基本原理与操作161

第二节 应用实例166

实例一 凝集素RCA120的结合特异性分析166

实例二 糖芯片在TGF-β1诱导下人肝星状细胞研究中的应用169

参考文献173

第十二章 糖结合蛋白分离纯化技术174

第一节 羟基化磁粒的制备174

第二节 糖链-磁粒复合物的制备176

第三节 糖结合蛋白的分离纯化178

第四节 糖结合蛋白的鉴定方法180

第五节 应用实例188

实例 肝癌患者和健康志愿者血清中甘露糖结合蛋白的分离纯化与鉴定188

参考文献200

第十三章 糖结合蛋白基因芯片技术201

第一节 糖结合蛋白基因芯片制备技术201

第二节 应用实例209

实例 糖结合蛋白基因芯片在肝癌研究中的应用209

参考文献211

第十四章 糖组学数据统计分析方法213

第一节 引言213

第二节 图像采集214

第三节 数据预处理219

第四节 寻找表达差异基因、蛋白质或糖链222

第五节 聚类分析224

第六节 统计分析软件及专家系统230

参考文献232

第十五章 用于糖组学研究的生物信息学技术233

第一节 糖基化位点预测与鉴定方法233

第二节 糖结合蛋白预测及分类244

参考文献257

第十六章 糖组学数据库258

第一节 糖组学相关数据库258

第二节 糖组学研究主要网络平台266

参考文献280

附录282

一 糖基因列表282

二 凝集素列表295

三 缩略语300

四 生物信息学相关数据库303