图书介绍

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分子动力学模拟的理论与实践
  • 严六明,朱素华编著 著
  • 出版社: 北京:科学出版社
  • ISBN:9787030373595
  • 出版时间:2013
  • 标注页数:248页
  • 文件大小:61MB
  • 文件页数:258页
  • 主题词:分子-动力学

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图书目录

第1章 绪言1

1.1分子动力学模拟的发展历史1

1.2 MD模拟的应用与意义6

1.3 MD模拟的发展趋势6

第2章 分子的物理模型13

2.1分子的物理模型在化学中的作用13

2.2原子、分子的几何模型15

2.3分子的经典力学模型19

2.4分子的量子力学模型29

第3章 分子间相互作用30

3.1分子间相互作用与势函数30

3.2分子间特殊势函数32

3.3分子间相互作用的起源34

3.4氢键相互作用39

3.5常用分子间相互作用势函数40

3.6无机巨分子物质的势函数43

3.7金属势45

3.8近程相互作用和长程相互作用46

第4章 常用分子力场48

4.1水分子力场48

4.2分子力场的种类58

4.3 MMn系列分子力场60

4.4全原子分子力场66

4.5联合原子分子力场70

4.6量子化学分子力场76

4.7通用力场80

第5章 分子体系的运动方程及其数值解83

5.1分子体系的运动方程(牛顿第二定律)83

5.2分子体系的运动方程(哈密顿运动方程)83

5.3常微分方程的数值解85

5.4分子体系运动方程的求解思路87

5.5分子体系运动方程的数值解88

5.6刚体运动方程的解90

5.7约束动力学94

第6章 分子动力学模拟的技巧96

6.1周期性边界条件96

6.2势函数的计算技巧99

6.3长程力的计算104

6.4温度和压力控制技术106

第7章MD模拟的统计力学基础111

7.1热力学的基本概念111

7.2统计系综和可实现状态115

7.3各态历经假设与MD模拟116

7.4体系可实现状态数的估计118

7.5统计系综的概率分布118

7.6非Hamilton体系的统计理论121

7.7演化算符与差分格式127

第8章 第一性原理分子动力学模拟135

8.1经典MD模拟的局限性135

8.2 BOMD和CPMD模拟方法135

8.3平面波基函数142

8.4赝势147

8.5 PIMD模拟152

8.6质子在甲醇分子和水分子之间迁移过程的AIMD模拟152

第9章 分子动力学模拟的应用157

9.1 MD模拟的计算机软硬件157

9.2模拟体系分子模型的建立160

9.3 MD模拟的初始条件163

9.4 MD模拟技术参数的确定164

9.5 MD模拟的过程164

9.6 MD模拟结果的处理165

第10章 分子力场的构建与MD模拟的应用实例178

10.1聚炔分子力场的构建178

10.2锂离子电池电解液的MD模拟182

第11章 与MD模拟有关的其他分子模拟方法199

11.1非平衡分子动力学模拟199

11.2 Brown动力学模拟207

11.3耗散粒子动力学217

11.4 Monte Carlo模拟223

参考文献233

附录 术语约定242

索引244

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