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第1章 数据预处理1

1.1 异常值的常见处理方法1

1.2 缺失值的填补8

第2章 多元线性回归分析14

2.1 多元线性回归的概念14

2.2 多元线性回归的模型结构14

2.3 多元逐步线性回归17

第3章 Logistic回归分析22

3.1 Logistic回归分析的基本概念22

3.2 Logistic回归的模型结构22

3.3 应用实例1：一般资料的Logistic回归23

3.4 应用实例2：列联表资料的Logistic回归27

3.5 应用实例3：多项 Logistic回归分析29

第4章 非线性回归拟合分析32

4.1 非线性回归基本概念32

4.2 应用实例1：对新增SARS病例数的预测分析32

4.3 应用实例2：对累计SARS病例数的预测分析37

第5章 生存分析41

5.1 生存分析的基本概念41

5.2 生存分析的资料特点41

5.3 生存资料的分析方法42

5.4 应用实例1：累积生存率的计算42

5.5 应用实例2：小样本生存率的Kaplan-Meier估计45

5.6 应用实例3：生存曲线比较的Log-rank检验47

5.7 应用实例4： Cox回归51

5.7.1 Cox模型结构与参数估计51

5.7.2 应用实例：Cox回归分析51

第6章 基于竞争风险模型的生存分析56

6.1 竞争风险模型56

6.2 应用实例：竞争风险模型的生存分析56

第7章 Meta分析62

7.1 Meta分析概述62

7.2 Meta分析的方法与步骤62

7.3 应用实例1：二分类资料的Meta分析63

7.4 应用实例2：连续资料的Meta分析71

第8章 剂量-反应模型的Meta分析77

8.1 剂量-反应关系的数据结构77

8.2 线性拟合78

8.3 非线性拟合-三次曲线拟合79

第9章 决策树模型分析82

9.1 分类的概念82

9.2 分类的步骤82

9.3 分类器性能的评估83

9.4 决策树分类器简介83

9.5 应用实例：决策树分析85

第10章 随机森林法提取特征属性88

10.1 随机森林方法基本概念88

10.2 基于平均基尼指数减少量的特征属性选择88

10.3 应用实例：随机森林法提取特征属性90

第11章 倾向性得分匹配方法94

11.1 倾向性得分匹配方法94

11.2 倾向性得分匹配方法的步骤94

11.3 应用实例：倾向性得分匹配95

第12章 用广义估计方程分析重复测量的定性资料102

12.1 广义估计方程的基本概念102

12.2 广义线性模型的结构102

12.3 GEE算法103

12.4 应用实例1：重复测量的实验数据103

12.5 应用实例2：问卷调查中的多选题数据105

第13章 基于支持向量机的微阵列数据分类109

13.1 支持向量机简介109

13.2 支持向量机的基本原理109

13.3 应用实例：支持向量机分类111

第14章 时间序列分析113

14.1 时间序列分析的基本概念113

14.2 时间序列分析的主要步骤113

14.3 应用实例：时间序列分析114

第15章 路径图分析118

15.1 路径图分析基本理论118

15.2 路径图分析的基本步骤118

15.3 应用实例：路径图分析119

15.3.1 第一个回归分析119

15.3.2 第二个回归分析121

15.3.3 第三个回归分析122

第16章 主成分分析与因子分析124

16.1 主成分分析概念124

16.2 应用实例1：主成分分析124

16.3 因子分析概念129

16.4 应用实例2：因子分析129

第17章 判别分析134

17.1 判别分析的概念134

17.2 常用的判别分析方法134

17.3 判别函数的验证135

17.4 应用实例：判别分析135

第18章 聚类分析144

18.1 聚类分析的概念144

18.2 K均值聚类法144

18.3 应用实例1： K均值聚类145

18.4 系统聚类法148

18.5 应用实例2：系统聚类149

18.6 绘制双向聚类热图153

第19章 关联规则156

19.1 关联规则的基本概念156

19.2 关联规则的质量和重要性156

19.3 关联规则分析的基本方法157

19.4 应用实例：关联规则分析157

第20章 两组ROC曲线下的面积比较161

20.1 ROC曲线的构建161

20.2 ROC曲线下面积162

20.3 两组ROC曲线下面积比较162

20.4 应用实例：两组ROC曲线下面积比较162

第21章 诊断准确性试验Meta分析166

21.1 诊断准确性试验Meta分析基本概念166

21.2 诊断准确性试验Meta分析的相关评价指标166

21.3 应用实例：诊断准确性试验Meta分析167

第22章 贝叶斯网络分析173

22.1 贝叶斯网络的概念173

22.2 应用实例：贝叶斯网络构建174

第23章 偏最小二乘回归分析179

23.1 偏最小二乘回归的基本步骤和原理179

23.2 应用实例：偏最小二乘回归分析180

参考文献185