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第1章 微生物发酵技术在药物研究中的应用1

1.1 微生物发酵药物的基本概念1

1.1.1 微生物发酵药物的概念1

1.2 微生物发酵药物的原理和技术方法1

1.2.1 微生物发酵药物的原理1

1.2.2 微生物发酵药物技术方法2

1.3 微生物发酵技术在药物研究中的应用7

1.3.1 促进植物药物有效成分溶出，增强药效7

1.3.2 双向发酵炮制有毒中药，降低有毒成分的含量、提高药用价值9

1.3.3 利用真菌发酵废弃药渣，变废为宝，拓展和利用资源11

1.3.4 利用植物内生菌发酵，直接提取植物活性成分13

1.3.5 利用药用植物毛状根发酵，获得多种活性成分21

1.3.6 利用共生菌发酵，发现药物新成分21

1.4 展望28

参考文献29

第2章 微生物转化技术在药物研究中的应用31

2.1 微生物转化药物的基本概念31

2.1.1 微生物转化药物的概念31

2.2 微生物转化药物的原理和技术方法31

2.2.1 微生物转化药物的原理31

2.2.2 微生物转化药物的技术和方法42

2.3 微生物转化在药物研究中的应用47

2.3.1 微生物转化在药物前体和具有治疗作用的活性物质生产中的应用47

2.3.2 微生物转化在甾体类药物研究中的应用47

2.3.3 微生物转化在手性药物研究中的应用57

2.4 微生物转化在天然药物定点修饰研究中的应用60

2.4.1 甾体类天然药物的转化定点修饰60

2.4.2 黄酮类中药成分的微生物转化61

2.4.3 萜类成分的微生物转化修饰62

2.4.4 皂苷类成分的微生物转化修饰70

2.4.5 香豆素类成分的微生物修饰75

2.4.6 生物碱类成分的生物转化75

2.5 微生物转化在提高天然药物水溶性研究中的应用77

2.6 物体外转化可以作为模型帮助确定药物代谢途径79

2.7 展望87

参考文献87

第3章 微生物组合生物合成技术在药物研究中的应用94

3.1 微生物组合生物合成的概念94

3.1.1 微生物组合生物合成的概念94

3.2 微生物组合生物合成技术的原理和策略95

3.2.1 微生物组合生物合成技术的原理95

3.2.2 微生物基因簇和组合生物合成的策略95

3.2.3 微生物基因簇组合生物合成天然产物的策略100

3.3 微生物基因簇在药物生物合成中的应用107

3.3.1 放线菌基因簇在药物生物合成中的应用107

3.3.2 黏细菌120

3.3.3 假单胞菌127

3.4 展望130

参考文献130

第4章 肠道微生物代谢技术在药物研究中的应用132

4.1 药物肠道微生物代谢的基本概念132

4.1.1 肠道微生物概念132

4.1.2 肠道微生物和药物代谢的关系133

4.1.3 肠道菌药物代谢的概念136

4.2 肠道微生物代谢药物的基本原理和技术方法136

4.2.1 肠道微生物代谢药物的基本原理136

4.2.2 药物肠道代谢的基本反应137

4.2.3 药物肠道菌代谢的模型147

4.2.4 药物代谢的检测方法160

4.3 肠道微生物对药物的转化在创新药物研究中的应用166

4.3.1 肠道微生物的种类167

4.3.2 肠道微生物的转化酶167

4.3.3 肠道微生物对药物转化的主要反应168

4.4 应用举例——计算机模拟全自动控制—体外胃肠道模拟系统（TIM）在药物生物代谢解毒中的应用199

4.4.1 TIM系统199

4.4.2 重组酵母对反式-肉桂酸的代谢（实例）201

4.5 展望203

参考文献203

第5章 海洋微生物在药物研究中的应用211

5.1 海洋微生物及海洋药物211

5.1.1 海洋微生物的概念211

5.1.2 海洋药物的概念211

5.1.3 海洋微生物药物产物来源212

5.2 海洋微生物的分类及特点212

5.2.1 海洋放线菌213

5.2.2 海洋真菌215

5.2.3 海洋蓝细菌215

5.2.4 海洋真核微藻215

5.2.5 变形细菌216

5.2.6 假单胞菌、弧菌及其他216

5.3 海洋微生物药物研究的技术和方法216

5.3.1 宏基因组的概念216

5.3.2 宏基因组学的研究方法220

5.3.3 宏基因组文库的建立及其克隆体系222

5.3.4 宏基因组学在应用中亟待解决的问题224

5.4 海洋微生物药物与海洋微生物次生代谢产物的研究225

5.5 已经进入临床和临床前研究的海洋微生物次生代谢产物283

5.5.1 Didemnin B283

5.5.2 Dolastatin 10283

5.5.3 Dolastatin 15284

5.5.4 Ecteinascidin-743285

5.5.5 Salinisporamide A285

5.6 海洋微生物的生物合成途径286

5.6.1 海洋药物研究现状286

5.6.2 海洋微生物次生代谢物生物合成基因簇287

5.7 海洋无脊椎动物共生菌次生代谢分离技术303

5.7.1 研究现状303

5.7.2 海洋微生物分离方法305

5.7.3 化学检测方法307

5.7.4 成像技术309

5.8 展望313

参考文献313

第6章 微生物浸出技术在中药创新研究中的应用317

6.1 微生物浸出的概念317

6.1.1 微生物浸出炮制中药概念的提出318

6.1.2 微生物浸出矿物中药的原理319

6.2 微生物技术在矿物中药创新研究中的应用335

6.2.1 微生物浸出技术在提高难溶中药水溶解性研究中的应用335

6.2.2 海洋微生物代谢技术在中药炮制研究中的应用340

6.3 应用实例342

6.3.1 雄黄微生物溶解液药物动力学研究342

6.4 展望348

参考文献349

中英文对照350